Anayasa Değişikliği için yapılan referanduma ilişkin oy verme işlemi Malatya'da zaman zaman yaşanan küçük çaplı tartışmalara karşın sorunsuz bir şekilde gerçekleştiriliyor. Güvenlik güçlerinin oy kullanma işlemi gerçekleştirilen noktalarda aldığı önlemlerle vatandaşlar oylarını rahatlıkla kullanabiliyor. 29 Mart 2009 yerel ve il genel meclisi seçiminde Malatya genelinde 488 bin 293 seçmen bulunurken, referandumda toplam 498 bin 639 seçmen sandık başına gitti.
12 Eylül darbesinin yıl dönümünde yapılan referandumda AK Parti Malatya milletvekillerinden Mehmet Şahin oyunu Kazım Karabekir İlköğretim Okulu'nda kullandı. Şahin, oyunu kullandıktan sonra yaptığı açıklamada, bunun bir yerel ya da genel seçim olmadığını, ülkenin geleceği ile ilgili bir halk oylaması olduğunu belirterek, ülkeye hayırlı olmasını diledi.
AK Parti Milletvekilleri İhsan Koca ve Mücahit Fındıklı da oylarını Fatih İlköğretim Okulu'nda kullandı. Mücahit Fındıklı, oy verme işlemi sonrası Türkiye'nin daha demokratik bir yapıya kavuşmasını arzuladıklarını kaydetti.
